改进了沙门氏菌食物中毒爆发的追踪和新的DNA测

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改进了沙门氏菌食物中毒爆发的追踪和新的DNA测

据《分子诊断学杂志》报道,这种检测方法可以快速、灵敏地区分沙门氏菌的亚型。

研究人员报道了一种灵敏而特异的检测沙门氏菌不同血清型的方法,为直接从标本中快速鉴定血清型铺平了道路。这种对现有检测方法的改进可以在快速追踪感染源方面发挥关键作用。该报告发表在爱思唯尔出版的《分子诊断学杂志》上。

美国疾病控制与预防中心(CDC)的最新数据显示,在美国,由沙门氏菌引起的食物中毒每年导致135万人感染,26500人住院,420人死亡。在疾病暴发期间,检测特定类型细菌的测试的速度和简单性对公共卫生调查人员追踪来源非常重要。

临床或食品样本中的沙门氏菌数量可能非常少,因此需要非常敏感的方法来检测它们。多重交叉置换扩增(MCDA)是一种可以快速检测非常少量DNA的方法,也可以在单一恒温条件下进行,这与PCR等其他方法所需的温度循环形成了对比。这使得它非常适合简单、快速、灵敏的细菌检测测试。尽管已经存在针对任何沙门氏菌的MCDA检测,但它并不能区分不同的血清型。澳大利亚新南威尔士州悉尼新南威尔士大学生物技术和生物分子科学学院的兰瑞廷教授解释说。

研究人员为沙门氏菌的七个血清(亚型)特异性靶点开发了一种MCDA分析。所有这些检测方法都能精确地检测到10个DNA拷贝,并能在大约8分钟内产生结果。重要的是,这些检测不需要专门的检测设备,简化了未来在临床或工业环境中的应用。将这7种血清特异性试验与现有的物种试验相结合,可以简化和加速沙门氏菌的检测。

本研究开发的检测方法是独特的,因为所使用的基因标记是在分析了数千个基因组的基础上选择的。因此,这些标记在将来证明沙门氏菌血清分型在培养独立诊断测试的时代;兰教授说。

区分沙门氏菌血清型的传统方法包括从样本中培养细菌,然后对它们进行测试,将它们分配给血清型。MCDA测试速度更快,因为它不需要首先在培养基中培养细菌。相反,它可以检测到非常少量的沙门氏菌DNA。

虽然沙门氏菌血清有数百种,但作者选择了在澳大利亚最常见的五种,它们导致了该国超过85%的沙门氏菌感染。然而,这些血清中至少有两个也是全世界沙门氏菌血清中数量最多的,因此研究人员认为该结果适用于其他地理区域。

沙门氏菌通常生活在动物和人类的肠道内,并通过粪便排出体外。人类可能因摄入受污染的水或食物,如生的或未煮熟的肉、家禽、蛋或蛋制品而受到感染。沙门氏菌中毒的可能症状包括恶心、呕吐、腹部绞痛、腹泻、发烧和头痛。

高灵敏度和特异性的沙门氏菌血清多重交叉置换扩增检测及血清分型张小梅,迈克尔·佩恩,王钦宁,维塔利·辛琴科和兰瑞婷,2020年4月28日,分子诊断学杂志。

DOI: 10.1016 / j.jmoldx.2020.02.006