超级计算机发现现有的骨质疏松药物有治疗COVI

- 编辑:大众自然网 -

超级计算机发现现有的骨质疏松药物有治疗COVI

一个由欧盟支持的高性能计算平台测试了已知分子对冠状病毒基因组结构的影响,并确定了一种已经注册的仿制药的疗效。

有大量的研究关注COVID-19的潜在治疗方法,包括正在试验的现有药物。也取得了一些进展。

由EXSCALATE4CoV项目资助的一个公私联合体宣布了抗击冠状病毒的有希望的结果。根据公告,雷洛昔芬是一种已注册的治疗骨质疏松症的仿制药,可能对有轻度症状感染的COVID-19患者有效。正如欧洲委员会所说的那样。

EXSCALATE4CoV平台汇集了德国、西班牙和意大利的超级计算中心、制药公司、大型研究中心和欧洲各地的生物研究所。它采用了高性能计算能力和人工智能与生物处理的独特组合。如同一份新闻稿所述。该平台拥有约120千兆次的计算能力,允许研究分子的行为,目的是找到一种有效的治疗冠状病毒的方法。千万亿次浮点运算指的是每秒进行1千万亿次浮点运算。

欧洲委员会的新闻稿还说:该联盟已经使用其超级计算机实际上测试了40万个分子。7000个分子被预先挑选出来,并在玻璃体中进行进一步的测试。雷洛昔芬是一种很有前途的分子:根据这个项目,它可以有效地阻止病毒在细胞内的复制,从而阻止疾病的发展。根据项目合作伙伴的说法,雷洛昔芬具有良好的耐受性,其安全性已知。超级冠状病毒联盟正在与欧洲药品管理局商讨建立人类临床试验的最快途径。

筛选过程需要几周,而不是几年

EXSCALATE4CoV平台可以在数周内完成筛选过程,而传统技术则需要数年时间。目前为止,在第一步中,它已经从25种不断进化的新型冠状病毒不同的蛋白质模型中识别出6种,每周收到不同的突变,并将其转化为数字形式,以供下一步使用。

欧盟委员会补充说,第二阶段是将冠状病毒蛋白质的数字结构与可用的分子库相匹配。在第三步,也就是最后一步,识别出的分子在比利时和德国的实验室里进行几次额外的生物筛选操作,以了解一个识别出的分子是如何与病毒模型相互作用的,并评估它能在多大程度上停止其活性。

项目合作伙伴希望,在下一阶段,EXSCALATE4CoV平台将扩大目前的测试,考虑到其化学库中5000亿分子中有500万分子的扩展库。这些大规模的虚拟筛选活动将得到欧洲三个最强大的计算机中心的支持和授权:CINECA、巴塞罗那超级计算中心和Jülich研究中心。EXSCALATE4CoV(百亿亿次冠状病毒病原体智能平台)项目将运行到2021年9月。