空间作图法确定了狼疮潜在的新的治疗靶点

- 编辑:大众自然网 -

空间作图法确定了狼疮潜在的新的治疗靶点

来自费城儿童医院(CHOP)的一组研究人员使用了一种新的方法来确定潜在的致病基因变化,从而确定了狼疮的两个新的潜在治疗靶点,同时也为更准确地确定其他自身免疫性疾病的致病变异铺平了道路。研究结果发表在《自然通讯》的网络版上。

全基因组关联研究(GWAS)利用整个基因组的变异,一个人的全套基因和相关DNA,以了解更多关于遗传疾病和特征。这些研究通常识别出数百个可能导致某种疾病的单核苷酸多态或变异的聚类,但这些研究本身无法识别出哪一个是罪魁祸首。这是因为绝大多数变异并不存在于基因本身,而是存在于其间的DNA中,而GWAS并不能解决哪些基因受到疾病相关多态性的影响。

系统性红斑狼疮是一种尚无治愈方法的自身免疫性疾病,既影响儿童,也影响成人,在少数民族中发病率较高。一些关于狼疮的研究主要集中在初始辅助性T细胞和其他血细胞,而这项研究旨在关注滤泡辅助性T细胞,它们在狼疮相关的免疫反应中发挥着更重要的作用。研究人员没有使用典型的GWAS方法,而是着手创建三维地图,将变异与它们可能调节的基因相匹配。他们的方法使用变异作为“路标”来识别正常组织中潜在的基因增强子。

“在这项研究之前,还没有为这种与卢普斯相关的细胞类型生成3d结构基因组图,”CHOP空间和功能基因组中心的联合主任安德鲁·d·威尔斯博士说,他和斯图朗·f·a·格兰特博士共同撰写了这项研究。“通过我们的方法,我们相信我们能够确定基因和途径,而这些基因和途径在狼疮中没有事先已知的作用。”

通过这种方法,研究团队确定了393个与3d基因相近的变异,因此可能与它们的调节有关。大约90%的变异在一个维度上被认为与他们的基因很遥远,但在研究小组创造的三维地图上,它们实际上很接近。研究人员能够确定两个激酶,HIPK1和MINK1,这两个激酶在狼疮中没有已知的作用。当这些酶以滤泡辅助T细胞为目标时,它们会抑制白细胞介素-21的产生,白细胞介素-21是一种调节抗体产生的细胞因子。

Wells说:“我们相信HIPK1和MINK1可以作为狼疮的有价值的治疗靶点,狼疮是一种急需新的治疗方案的疾病。”“我们还想采用我们在这项研究中使用的方法,并将其应用于其他自身免疫性疾病,帮助查明更多可能被GWAS单独掩盖的原因变异。”

Wells还表示,他们的团队希望开发HIPK1转基因小鼠模型,以研究它们对实验性狼疮的易感性,以及HIPK1对抗病毒免疫的潜在影响。